Ejemplos de trabajos

Multihilo (OpenMP, NumPy, multiprocessing)

#!/bin/bash
#SBATCH -p CPU
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=32
#SBATCH --mem=64G
#SBATCH --time=12:00:00

export OMP_NUM_THREADS=$SLURM_CPUS_PER_TASK
./mi_programa

MPI en varios nodos

La forma recomendada es usar un contenedor con tu stack MPI (ver Contenedores):

#!/bin/bash
#SBATCH -p CPU
#SBATCH --nodes=3
#SBATCH --ntasks-per-node=64
#SBATCH --time=06:00:00

srun --mpi=pmix \
     --container-image=/data/<grupo>/mi-imagen-mpi.sqsh \
     mi_programa_mpi

Mucha memoria

#!/bin/bash
#SBATCH -p MEM
#SBATCH --cpus-per-task=48
#SBATCH --mem=1000G
#SBATCH --time=2-00:00:00

python3 analisis_grande.py

Arreglo de trabajos (barrido de parámetros)

Lanza 100 trabajos independientes, cada uno con un índice distinto:

#!/bin/bash
#SBATCH -p CPU
#SBATCH --array=1-100%20        # máximo 20 a la vez
#SBATCH --cpus-per-task=2
#SBATCH --mem=4G
#SBATCH --time=02:00:00
#SBATCH --output=logs/%x_%A_%a.out

python3 simular.py --semilla $SLURM_ARRAY_TASK_ID

Ver cuánto usó un trabajo

seff <jobid>                 # eficiencia de CPU y memoria (por confirmar)
scontrol show job <jobid>